カフェインの効果が生理的に重要(又は顕著)であるかどうかは要素の数によります。各個人はカフェインに異なる反応をします。例として、カフェインは妊娠中の女性には、普通の大人より3倍の長さ留まり、喫煙者は喫煙しない人の2倍速くカフェインを排除します。このことで、何故女性が妊娠の後の方の段階でコーヒーにより繊細になるのか、そして何故ヘビースモーカーが何故コーヒーを大量に飲むのかの説明がつきます。その他、定期的にカフェインを消費する人が突然摂取を止めると顕著に現れる事もあります。体はカフェインに慣れるので、定期的に摂取する人々はしない人々よりも刺激に繊細ではなくなります。事実、人々は経験に従いコーヒーをいつ飲むのか定める傾向があります。恐らく寝る前に飲む人はいないでしょう。
コーヒーの生理学的効果の中で、最も知られているのは神経系に対する刺激でしょう。 1杯か2杯のコーヒーで目が覚め集中できるようになります。カフェインは疲れと闘い、低迷する実行力を回復させる事ができます。しかし繊細な人には、カフェインは眠気の来るのを遅らせたり、睡眠時間を減少させたり、睡眠の質を低下させたりします。カフェインはムードに良い気持ちから不安な気持ち、ナーバスからイライラしたりと様々な影響を与えますが、一時的であり摂取量によります。
短時間におけるその他のカフェインの生理的な影響は、血圧上昇、プラズマカテコールアミン上昇、プラズマレニン上昇や無血清脂肪酸上昇などを含み、尿や 胃酸 の生産も上昇します。ノーマルな個人の定期的な消費は迅速に耐性を持ち不都合な影響はありません。
広範囲で大部分の科学的で疫学的な証拠は飲料に含まれるコーヒーとカフェインの通常で定期的な消費は心臓病や心疾患、胎児への被害、良性乳癌や一切の種類の癌などと関係がない事を証明したと言われています。不定期な心拍症状のある人は、アルコール、運動、ストレスや薬のように、カフェインが不整脈や心室期外収縮を促進する事で知られている為、カフェイン抜きのコーヒーを飲む方が良いと言われています。
参考
Evaluation of Caffeine Safety, a scientific status summary by the Institute of Food Technologists' Expert Panel on Food Safety and Nutrition, 1987. Food Technology, Institute of Food Technologists, Chicago , 41(6):105-113.June 1987